Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC174Q6PII3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms