Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A12Q504Y0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms