Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM187BQ17R55 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms