Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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