Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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