Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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IRF4Q15306 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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IRF4Q15306 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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IRF4Q15306 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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