Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms