Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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