Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms