Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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