Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms