Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms