Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms