Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms