Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms