Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP2P16035 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms