Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALM3P0DP25 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms