Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLBP06746 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLBP06746 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLBP06746 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLBP06746 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLBP06746 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLBP06746 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms