Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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HOXC11O43248 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC11O43248 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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