Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF1O43189 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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