Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB15A6NHN6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms