Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms