Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCML1Q9UN30 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCML1Q9UN30 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms