Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms