Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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