Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf42Q9NWW7 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms