Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDP1Q9NUW8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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