Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPIFA1Q9NP55 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms