Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms