Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms