Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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