Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms