Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC50Q8IVM0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms