Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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