Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms