Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms