Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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C10orf55Q5SWW7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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