Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms