Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms