Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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