Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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