Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCM1Q15154 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCM1Q15154 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCM1Q15154 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCM1Q15154 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms