Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms