Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms