Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNC3Q14003 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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