Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms