Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTF3Q12996 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTF3Q12996 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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