Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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