Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAF2Q12933 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms