Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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